はい。
「.htaccess」に記載をすることでアクセスを限定できます。
方法はいくつかありますが、参考としてRewriteRuleを以下で書き換えれば「wwwなし（または wwwあり）」で、アクセスできないようにできます。
「wwwあり」でのみアクセス可能にする場合
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} !^www. [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://www.%{HTTP_HOST}%{REQUEST_URI} [R=301,L]
※SSL利用時は、3行目を「 https:// 」に変更してください。
「wwwなし」でのみアクセス可能にする場合
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www.(.*) [NC]
RewriteRule ^(.*)$ http://%1%{REQUEST_URI} [R=301,L]
※SSL利用時は、3行目を「 https:// 」に変更してください。